Dalsze losy bohaterów serialu anime na podstawie mangi Masashiego Kishimoto. Naruto Uzumaki to młody ninja z wioski Konohagakure. W miejscowości szkolą się ninja szkolą się w sztuce wykorzystywania chakryu w walce, aby korzystać w potężnych Jutsu. Wraz ze swoimi towarzyszami: Sasuke Uchihą, z którym wciąż rywalizuje, oraz Sakurą Haruno tworzy ekipę pod przywództwem Kakashiego Hatake. Jednak Naruto nie jest zwykłym chłopcem. Gdy był niemowlęciem, czwarty Hokage (przywódca wioski) zamknął w nim demona, aby ochronić mieszkańców okolicy. Naruto i jego przyjaciele będą musieli zmierzyć się ze złowrogim Orochimaru.Naruto i przyjaciele orientują się, że wpadli w pułapkę iluzji. Zostają zaatakowani przez klony. Gdy są zmęczeni walką, pojawiają się prawdziwi Ninja Deszczu. Czwórka bohaterów musi znaleźć siły, by pokonać przeciwników. Zaniepokojeni sytuacją zastanawiają się, dlaczego Kabuto im pomaga.