Nadeszły trudne czasy. Wiele królestw funkcjonuje w zjednoczeniu, lecz ten sojusz jest niestabilny. Mistrz Ninja Spinjitzu musi wyszkolić nową armię dzielnych wojowników. Wierzy, że śmiałkowie zdołają doprowadzić do odnalezienia Smoków Żywiołu, dzięki którym planeta uniknie tragicznego końca. Muszą się przy tym spieszyć, zanim smoczą energią zawładną siły zła i sprowadzą na świat zagładę.Sora orientuje się, że jeden z jej dawnych wynalazków służy złym celom. Prowadzi przyjaciół do Imperium, ale na miejscu ekipa musi się rozdzielić.