Dalsze perypetie z życia lekarzy prestiżowego szpitala św. Bonawentury w Kalifornii. Dr Shaun Murphy (Freddie Highmore) to młody chirurg, u którego został zdiagnozowany autyzm. Mimo to jest wybitnym specjalistą w swojej dziedzinie. Chociaż nie potrafi nawiązywać relacji uczuciowych z innymi ludźmi, to stara się skutecznie leczyć swoich pacjentów.Shaun i Lea spierają się o sposób postępowania z dwutygodniowym Steve'em. Murphy wraca do pracy. Wraz z doktor Lim podejmuje się leczeniu małego Jacka Pierce'a. Chłopcu niezbędny jest przeszczep serca. Wkrótce okazuje się, że adoptowana córka Morgan, Eden, również potrzebuje nowego narządu. Shaun zostaje zmuszony do podjęcia trudnej decyzji. Dr Reznick stara się zapanować nad wszystkim samodzielnie, jednak po konfrontacji z Alexem zmienia nastawienie. Jordan przeżywa trudne chwile po odejściu Danny'ego. Po rezygnacji Andrewsa zarówno Glassman, jak i Audrey usiłują wybrać drugiego na tymczasowego prezesa szpitala. Aaron nadal jest skonfliktowany z Murphym. Postanawia jednak zabrać Steve'a, by rodzice mogli trochę odpocząć. Przedstawia się jako jego dziadek.