Od śmierci żony doktor John Dolittle jest pogrążony w żałobie i żyje jak pustelnik. Zostaje jednak zmuszony do porzucenia swojej samotni. Królowa Wiktoria zapadła bowiem na tajemniczą chorobę. Tylko umiejący komunikować się ze zwierzętami weterynarz może jej pomóc. Okazuje się, że władczyni podano podstępem truciznę, a jedynym skutecznym lekarstwem jest magiczny owoc. Dolittle razem ze swoją pierzastą i włochatą menażerią wyrusza w podróż, aby odszukać antidotum dla monarchini. Wspólnie z towarzyszami kieruje się w stronę wyspy, o której krążą legendy. W misji pomaga mu asystent Tommy. Grupę śmiałków czekają niesamowite przygody i niebezpieczne konfrontacje z dawnymi wrogami, w których będą musieli pokonać własne słabości.