Ekscentryczny podróżnik lord Richard Croft (Dominic West) zaginął w niewyjaśnionych okolicznościach. Mimo upływu kolejnych lat jego córka, Lara (Alicia Vikander), nie potrafi się z tym pogodzić. Kiedy w jej ręce trafia wiadomość pozostawiona przez ojca, orientuje się, że jego zniknięcie ma związek z grobowcem nazywanym Matką Śmierci. Mężczyzna, zgłębiając legendę o japońskiej cesarzowej Himiko, uwikłał się w niebezpieczną intrygę i dobrze wiedział, że może zginąć. Lara postanawia ruszyć śladem jego ostatniej sprawy i odnaleźć tajemniczy artefakt. Okazuje się bowiem, że grobowiec zagraża losom całego świata. Zdeterminowana dziewczyna porzuca swoje dotychczasowe życie i dociera na wybrzeże mitycznej wyspy nieopodal Japonii. Na miejscu czeka ją walka z własnymi słabościami i groźnymi ludźmi, którzy próbują ją powstrzymać. By wypełnić misję, musi pokonać szereg pułapek i rozwiązać starożytne zagadki.