W kolejnym sezonie, dwunastym, zespół Gibbsa (Mark Harmon) znów stawi czoła zagadkom kryminalnym, w których nie wszystko jest tym, czym się wydaje na pierwszy rzut oka. Agenci muszą m.in. odnaleźć zabójcę dowódcy marynarki wojennej, eskortować geniusza komputerowego i poznać okoliczności śmierci Anglika przebywającego w USA.Tajemniczy morderca poddał okrutnym torturom znaną w środowisku naukowym kobietę, pozbawiając ofiarę głowy za pomocą maszyny do duszenia. Gibbs próbuje namierzyć zawodową partnerkę zmarłej naukowiec. Ostatnio obie prowadziły badania w Rosji. Tu może kryć się klucz do rozwiązania tej kryminalnej zagadki.