Agentka specjalna Jane Tennant (Vanessa Lachey) i jej podwładni zmagają się ze sprawami kryminalnymi w Pearl Harbor na Hawajach. Dotyczą one ewentualnych zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego Stanów Zjednoczonych. Pomagają im wykwalifikowani specjaliści i lokalni mieszkańcy.Zespół NCIS wznawia dochodzenie w sprawie znalezionych kości z okresu II wojny światowej. w 80. rocznicę zbombardowania Pearl Harbor. Śledczy odkrywają, że należą one do ocalonego z ataku stulatka.