Mija rok, od kiedy Sherlock (Jonny Lee Miller) wyprowadził się z Londynu i zakończył współpracę z brytyjskiego wywiadu. Detektyw wraca do Nowego Jorku z zamiarem podjęcia pracy w policji. Jego nową asystentką zostaje Kitty Winter (Ophelia Levibond). Niejasne powody jej zatrudnienia wkrótce zaczynają negatywnie wpływać na relacje łączące detektywa i Joan (Lucy Liu). W życiu Watson pojawia się nowy mężczyzna, Andrew (Raza Jaffrey). Jest on całkowitym przeciwieństwem Holmesa - ma poukładane życie i rzadko wpada w tarapaty.Kiedy dwójka nowojorskich ratowników zostaje zabita podczas porwania, Holmes i Watson dołączają do poszukiwań mordercy, który ma zakładniczkę. W tym czasie Holmes uzyskuje ważne informacje na temat swojego sponsora przy leczeniu uzależnienia, co czyni jego relację z Alfredo bardziej napiętą.